Myhrer nära pallen i Zagreb
Den svenske alpinstjärnan, som vann på orten 2011, hade 18 hundradelar upp till pallen efter första åket och låg sexa, lyckades sedan klättra två placeringar i andra och var till slut tio hundradelar från pallen.
– Ett bra åk. Det var lite mer uppåkt än i första, men jag försökte gå för det och växla upp tempot, sade Myhrer i SVT.
36-åringen kom in lite sent i vissa kurvor och kunde inte attackera fullt ut.
– Det var lite samma som i första, jag tappade lite på slutet och kom in lite fel i spåren och blev straffad hela vägen in i mål, tyvärr. I övrigt är jag väldigt nöjd.
Myhrer får därmed vänta på sin andra pallplats för säsongen, som är hans sista.
Svensken inledde slalomsäsongen med en femteplats i finländska Levi och följde upp det med en andraplats i franska Val d'Isère.
Clément Noël, Frankrike, vann tävlingen i Zagreb, sju hundradelar före schweizaren Ramon Zenhäusern och tjugonio före italienaren Alex Vinatzer.
Startfältets andra svensk, Kristoffer Jakobsen, körde ur i första åket.
Nästa tävling körs i italienska Madonna di Campiglio på onsdag.